Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPL40Q9NQ50 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms