Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC52A3Q9NQ40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC52A3Q9NQ40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms