Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9BQ9NQ34 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM9BQ9NQ34 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM9BQ9NQ34 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM9BQ9NQ34 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms