Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASCL3Q9NQ33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASCL3Q9NQ33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASCL3Q9NQ33 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASCL3Q9NQ33 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms