Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MKKSQ9NPJ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms