Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCB9Q9NP78 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms