Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUFT1Q9NNX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUFT1Q9NNX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUFT1Q9NNX1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms