Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC24A3Q9HC58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC24A3Q9HC58 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms