Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELL3Q9HB65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ELL3Q9HB65 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELL3Q9HB65 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms