Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UPF2Q9HAU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UPF2Q9HAU5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms