Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNPO2LQ9H987 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNPO2LQ9H987 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms