Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXorf56Q9H5V9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXorf56Q9H5V9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms