Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF41Q9H4P4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms