Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS11Q9H270 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS11Q9H270 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS11Q9H270 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms