Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEP44Q9C0F1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CEP44Q9C0F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEP44Q9C0F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms