Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4CQ9C0C4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms