Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXP3Q9BZS1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXP3Q9BZS1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXP3Q9BZS1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms