Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARD6BQ9BYG5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms