Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM5DQ9BY66 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM5DQ9BY66 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KDM5DQ9BY66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KDM5DQ9BY66 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms