Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC46A2Q9BY10 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A2Q9BY10 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms