Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDCA4Q9BXL8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDCA4Q9BXL8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDCA4Q9BXL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDCA4Q9BXL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDCA4Q9BXL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDCA4Q9BXL8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDCA4Q9BXL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms