Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSM14BQ9BX40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSM14BQ9BX40 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms