Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA5Q9BWX5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATA5Q9BWX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATA5Q9BWX5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms