Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM106CQ9BVX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM106CQ9BVX2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM106CQ9BVX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM106CQ9BVX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms