Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC11Q9BVV2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC11Q9BVV2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC11Q9BVV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms