Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDFIP1Q9BT67 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDFIP1Q9BT67 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDFIP1Q9BT67 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms