Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP2Q9BSJ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms