Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC50A1Q9BRV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC50A1Q9BRV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms