Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms