Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC77Q9BR77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC77Q9BR77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC77Q9BR77 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC77Q9BR77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199 ms