Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PMCHL2Q9BQD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PMCHL2Q9BQD1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms