Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms