Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TREX2Q9BQ50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TREX2Q9BQ50 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX2Q9BQ50 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms