Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRRX2Q99811 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRRX2Q99811 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms