Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5SQ99766 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5SQ99766 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP5SQ99766 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms