Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHP1Q99653 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHP1Q99653 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHP1Q99653 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHP1Q99653 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHP1Q99653 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHP1Q99653 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms