Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDCA3Q99618 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA3Q99618 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCA3Q99618 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA3Q99618 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms