Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PSMD1Q99460 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSMD1Q99460 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSMD1Q99460 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms