Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC5LQ99459 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC5LQ99459 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC5LQ99459 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC5LQ99459 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms