Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBL7Q96S82 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBL7Q96S82 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBL7Q96S82 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms