Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A12Q96S37 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC22A12Q96S37 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC22A12Q96S37 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms