Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CICQ96RK0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CICQ96RK0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CICQ96RK0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CICQ96RK0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms