Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF13CQ96RJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms