Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP4Q96P64 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP4Q96P64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms