Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP3Q96P20 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NLRP3Q96P20 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP3Q96P20 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms