Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNDC3BQ96NL0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RUNDC3BQ96NL0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms