Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FRMD6Q96NE9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMD6Q96NE9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FRMD6Q96NE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms