Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMTM3Q96MX0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMTM3Q96MX0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms