Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ROBO3Q96MS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ROBO3Q96MS0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ROBO3Q96MS0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ROBO3Q96MS0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms