Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CFAP57Q96MR6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP57Q96MR6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP57Q96MR6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms