Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC138Q96M89 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC138Q96M89 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC138Q96M89 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms